La carrera de Medicina, perteneciente a la Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad Nacional de Entre Ríos, fue presentada en la convocatoria nacional para la acreditación de carreras de Medicina. La Resolución CONEAU 346/2024 acreditó la carrera por seis años, tras evaluar que cumple con todos los estándares requeridos. El rector de la Universidad, Andrés Sabella, sostuvo que "es muy significativo para la carrera y para la UNER en su conjunto, ya que da cuenta del compromiso institucional con el mejoramiento permanente de la calidad académica, expresado en las acciones que venimos desarrollando sostenidamente para asegurar la calidad de nuestros planes de estudios, de nuestro cuerpo docente y nuestras capacidades para generar y transmitir conocimiento"
Además, remarcó que es resultado "de un trabajo coordinado entre las facultades y el Rectorado, ya que si bien focaliza en una carrera en particular, implica también la evaluación de dimensiones institucionales fundamentales para que los procesos formativos cumplan los estándares fijados por el sistema".
Este fue el primer ciclo de acreditación de la carrera, que había sido presentada en 2015 para obtener el reconocimiento oficial provisorio de su título y poder iniciar sus actividades.
La evaluación involucró indicadores como la calidad del plan de estudios, cuerpo académico, la formación y desempeño de la comunidad graduada, y la infraestructura.